生態学のデータ解析 - 本/データ解析のための統計モデリング入門

岩波書店から出版予定の本 (久保 岩波本) について

• 書名: データ解析のための統計モデリング入門: 一般化線形モデル・階層ベイズモデル・MCMC
  • http://www.iwanami.co.jp/moreinfo/006971+/top.html
  • 2012 年 5 月に出版 --- 岩波書店で出版準備作業中
  • 現時点での目次: kuboTOC20120116.pdf
    • 講義のーと の内容を詳しく説明したもの
  • 2008 年 4 月時点での メモ

とりあえずの (一時的な) データファイルおきば

• 第 2 章 data.RData
• 第 3 章 data3a.csv
• 第 4 章 data.RData (m.data の一列目)
• 第 5 章 (第 3 章のデータ)
  • pb.R
• 第 6 章
  • data4a.csv (ロジスティック回帰)
  • data4b.csv (offset 項)
  • d.RData (ガンマ分布 GLM)
• 第 7 章 data.csv
• 第 8 章 data.RData
• 第 9 章 d.RData
  • model.bug.txt
  • runbugs.R
  • R2WBwrapper.R (9, 10, 11 章で使用)
• 第 10 章 data7a.csv
  • runbugs.R
  • model.bug.txt
  • (ブロック差) d1.csv
    • runbugs.R
    • model.bug.txt
• 第 11 章
  • 例題データ Y.RData
  • CAR model の例 (11.2.2 項, 11.3 節)
    • runbugs.R
    • model.bug.txt
  • GLMM model の例 (11.2.1 項, 11.5 節)
    • runbugs.R
    • model.bug.txt
  • 全部まとめて推定 (欠測あり・なし，CAR と GLMM)
    • runbugs.R
    • set.data.R
    • model.bug.txt

自由にダウンロードできる Appendix についてのメモ

準備しようかと予定している内容

• 主要な作図コードなど (R)
  • 例題の生成とかも?
• BUGS code
  • R2WinBUGS な R コード
• 第 3 章 (GLM)
  • 多重共線性と説明変数間の相関
• 第 6 章 (GLM 2)
  • 正規分布，ガンマ分布の例題をくわしく
• 第 7 章 (GLMM)
  • 負の二項分布 (6 章?)，混合ポアソン分布の統計モデル
• 第 9 章 (ベイズ化 GLM)
  • WinBUGS の使い方をもっとくわしく
  • 数値計算後のクラス変換，作図など
  • JAGS 対応!! (第 9-11 章)
• 第 10 章 (ベイズ化 GLMM)
  • 個体差+植木鉢差の例題をもっとくわしく