KuboWeb top

更新: 2016-03-13 16:47:29

生態学のデータ解析 - 統計モデリング入門ファイル2016a

本/データ解析のための統計モデリング入門」の例題ファイル置き場です (短縮 URL) http://goo.gl/8jE5WH

  1. 確率分布:ポアソン分布
  2. ポアソン回帰の GLM
    • 種子数 data3a.csv
    • うまく読めない場合は R 上で以下の命令を実行してください:
      • d <- read.csv("http://hosho.ees.hokudai.ac.jp/~kubo/stat/2016/Fig/poisson/data3a.csv")
  3. 確率分布:二項分布,ロジスティック回帰の GLM
    • 生存種子数 survival.RData (二項分布の説明)
      • あるいは data <- c(4,3,4,5,5,2,3,1,4,0,1,5,5,6,5,4,4,5,3,4)
    • data4a.csv (ロジスティック回帰)
  4. MCMC と階層ベイズモデル
    • ベイズモデル関係一式: jagsMCMC.zip (file size 10MB!! 注意!)
      • jags1: 第 8 章の MCMC 例題の JAGS 版
      • jags2: 第 10 章前半の JAGS 版
      • jags3: 第 10 章後半の JAGS 版
    • (参考) JAGS の mcmc.list を bugs データに変換する関数: mcmc.list2bugs.R