生態学のデータ解析 - R 関連の参照

• ここでは統計ソフトウェア R 全般に関する WWW と文献の情報を紹介します
• R は統計ソフトウェア (あるいは「データ解析環境」とも呼ばれています) でデータ解析と作図の統合的な環境を提供してくれます
  • R は free software です

    

  • R のインストール, R のとりかかり, R プログラミングの基礎 (生態学会の自由集会)
  • 久保がインストールしてる R package の help

(もくじ)

• WWW
• 書籍

WWW 

• R の中心的な website は http://www.r-project.org/ です
  • R のインストール 参照
  • R サイト検索 (RsiteSearch) http://search.r-project.org/cgi-bin/namazu.cgi
• R gonzui (http://rgonzui.nakama.ne.jp/): 中間栄治さんが作った R ソースコードデータベイス
  • 困ったときにここでコードをながめると解決するかも
• R graphical manuals: http://cged.genes.nig.ac.jp/RGM2/index.php
  • R の example() の図の一覧です
• 「Rによる保健医療データ解析演習（仮題）」http://phi.med.gunma-u.ac.jp/msb/index.html
  • 中澤港さん による R を使った統計解析の教科書
• Rで忘れがちな有用コマンド in EconWiki
• 統計処理ソフト R 入門 講習会資料: http://androids.happy.nu/ja/r-intro-lecture.html
  • 中西政志さんによる解説
• 「Rによるデータ解析」: http://aoki2.si.gunma-u.ac.jp/taygeta/Rstat.cgi
  • 青木繁伸さん による R の教科書
  • R による統計処理 - 青木さんが作った関数が公開されています
• R for Beginners: http://ftp.ecc.u-tokyo.ac.jp/CRAN/doc/contrib/Paradis-rdebuts_en.pdf
  • 無料で入手できる短いけれど良い R 入門書になっています
• Jin先生の R 用例の連載
• RSeek.org - R 関連の検索エンジン
• Wikipedia: http://ja.wikipedia.org/wiki/R%E8%A8%80%E8%AA%9E
  • 英語版: http://en.wikipedia.org/wiki/R_programming_language
• RjpWiki - Rに関する日本語の情報交換
• R-Tips - 統計解析ソフト R の備忘録頁
• R でプログラミング：データの一括処理とグラフ描き - 竹中明夫さんによるデータの一括処理と図化のプログラミングの解説
• 鳥学会 2005 自由集会 - 統計言語Rで一般化線型モデル解析 --鳥屋にやさしい統計のお勉強--
• Journal of Statistical Software の vol.22 は ``Special Volume: Ecology and Ecological Modelling in R'' である (粕谷さん馬車馬 blog で紹介されてた内容)
• CRAN Task View: Analysis of ecological and environmental data - 生態学・環境科学に有用な package (CRAN 内) について概観している
  • なお CRAN とは "The Comprehensive R Archive Network" であり，世界各地の R ユーザーたちが開発した R package を配布しているサイトである - http://cran.r-project.org/
• Google's R Style Guide: http://google-styleguide.googlecode.com/svn/trunk/google-r-style.html

書籍 

• RjpWiki 内の R本一覧
• Books related to R - r-project.org のまとめ
  • Use R シリーズ (Springer)
• the R tips (舟尾暢男, 2005, 九天社) - R つかいの手もとに一冊必要な本です

  

• データ解析環境「R」 ( 舟尾暢男・高浪洋平, 2006, 工学社) - 上よりさらに入門的な本

  

• The R Book (岡田昌史編, 2004, 九天社) - 「データ解析環境Rの活用事例集」，これは「R でこんな解析できないか?」を調べるときの事例集です
• Statistics: An Introduction Using R (M.J. Crawyley, 2005, John Wiley & Sons) - 生態学の事例を使った統計学 & R の入門書

  

• Introductory Statistics with R (P. Dalgarrd, 2002, Springer) - わかりやすい R の入門書
  • この本の翻訳: Rによる医療統計学 (岡田監訳, 2007, 丸善) も出版されている
• R プログラミングマニュアル (間瀬茂, 2007, 数理工学社) - R プログラミングに有用な，つまり R 挙動の詳細について多数の例題で示した本．類書がまったくない，まったくすごい一冊．

  

• R Graphics (P. Murrell, 2005, CRC press) - R のもっとも重要な機能のひとつ，作図まわりの詳細な解説本です