ぎょーむ日誌 2012-05-(11-20)
2012 年 05 月 11 日 (金)
-
0620 起床．
ラジオ体操．
弁当・朝飯の準備．
朝飯．
コーヒー．
0740 自宅発．
0810 研究室着．
-
結論からいうと，
けっきょくのところ今日も一日 mailing list
移転ばかりでオワってしまった
……
なんとか移行できたけど．
-
まずは Postfix 問題．
これはかなり奇妙な状況で，
-
ここから外部には出せる
-
外部からここには配送されない
(
user unknown)
-
local (中→中) にも配信されない
(error なし，どこかに蒸発)
といったかんじ．
何か北大クラウドの特殊事情，
たとえば各ノードは複数の IP アドレスが付与されている，
といったことに関係あるのかもしれない．
これまでのところ
qmail
意外の MTA にはどれも問題があったので
……
そして qmail では mailman を動かせない．
2012 年 05 月 12 日 (土)
-
0620 起床．
ラジオ体操．
弁当・朝飯の準備．
朝飯．
コーヒー．
[こーひー]
板東珈琲
の「おおわし」ブレンド．
コーヒー油がにじむ深煎り．
こういうのはひさしぶりなので
(なぜか浅めのやつばかり飲んでた)
苦めの味を楽しみました．
-
1200 自宅発，
ミニ大通公園走．
曇天．
かなり寒い．
気温 7-8 度ぐらい．
1245 帰宅．
体重 73.4 kg．
うんどう不足ぶとりだなぁ
……
[ヤエザクラ]
ミニ大通公園内．
[北海道知事公館の庭]
こういうふうに公開されてます．
今日は気温が低いのであまりヒトがいなかった．
-
昼飯の準備．
昼飯．
-
今度は研究室さーばーではなく生態学会さーばーの
mailman
問題 (archive が public になってる) を指摘していただいたので，
修理にとりくんでみる．
いちいち web interface でなおすのもしんどいので，
config.pck
をコマンドラインで変更する方法をいろいろ調べてみた．
# for f in */config.pck; do echo $f; /usr/lib/mailman/bin/dumpdb $f | grep archive_private; done
comaward/config.pck
'archive_private': 1,
eafes_wg/config.pck
'archive_private': 1,
esj-kanto/config.pck
'archive_private': 1,
*****/config.pck
'archive_private': 0,
...
ふーむ，
17 個ある mailing list のうち 5 個で「公開」になっていたか．
これを自動的にぱぱっと修正できればいいんだけど，
どうも withlist
で interactive にやるのが無難なようなので，
ループ & copy-paste でしのぐ．
# for m in *; do /usr/lib/mailman/bin/withlist -l -i $m; done
Loading list comaward (locked)
The variable `m' is the comaward MailList instance
>>> m.archive_private=1
>>> m.Save()
>>> (Ctrl+D でぬける)
...
-
AEON 桑園に買い出しにいく．
その後，
パン屋ココペライにもよってみたのだが
……
さすがは桑園かいわいの有名店，
土曜日 & 15 時すぎには，
もう店のなかはほとんどからっぽ売り切れ状態でした．
ちょっとだけ残っていたので，
選択の余地なくそれらを購入．
-
帰宅してひとやすみ．
怠業しつつ，
鶏レバのショウガ煮をつくる．
-
晩飯の準備．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0830):
ピッツァ．
- 昼 (1310):
ニラ卵うどん．
- 晩 (1920):
米 0.5 合．
ダイコン・ニンジン・ブナシメジのコンソメスープ．
カツオのたたきとタマネギ．
モヤシ・ネギ・豚肉の炒めもの．
鶏レバのショウガ煮．
2012 年 05 月 13 日 (日)
-
0800 起床．
ラジオ体操．
朝飯．
コーヒー．
-
研究室さーばーの移転 (すごく古い PC → 北大くらうど内)
移転はなんとか終了．
けっきょく，
今回も
hosho.ees.hokudai.ac.jp
というホスト名を変更できなかった．
これを機会に
eco.ees.hokudai.ac.jp
といったより短く意味不明度の低いものにかえたったんだけど．
-
URL を変更するのは容易ではない
……
あちこちからリンクをはられていたり，
RSS がどうこうといった問題があってですね．
恒久的な転送設定も可能なんだけど，
先日引用したメイルにもあるとーり，
北大ネット管理者たちはなぜかしら北大クラウドのノードに複数の
host 名をつけなことにしているようなので，
そのあたりも難しい．
-
まあ，
近日中に古い PC (もと研究室さーばー，今は別の host 名を付与されている)
を撤収しますか．
-
残された問題はバックアップだな
……
「北大くらうど」なる名称とはうらはらに，
じつはこのあたりちっとも「くらうど」的ではない仕様なんで．
これまで研究室さーばーだった古い PC は，
今さらながらだけど，
内蔵させておいた backup 用の HDD がけっこうこわれぎみのようだな．
-
1105 自宅発，
北大構内走．
晴．
1205 帰宅．
体重 73.2 kg．
あいかわらず，
減らない．
[北大農学部・苗畑突破るーと]
(大きな地図で見る)
「石山通」をはさんで西側が苗畑で東の茶褐色なあたりが農学部，
そのあいだが陸橋で接続されている．
自宅から農学部方面に行く最短ルートは，
苗畑に真西から接近して JR 高架下をくぐり，
鉄柵をよじのぼって乗り越えるというもの．
あとは，陸橋入り口 (上の写真) から
陸橋を渡るだけ (下の写真)．
-
今日は外で昼飯．
天気がよいのでぷらぷらと 2 時間ほどあちこちうろうろ．
買いものとかも．
-
帰宅して怠業．
-
晩飯の準備．
晩飯．
-
明日は紙ごみの日なので，
大量の紙ごみをパッキングして出す．
ついでに，
近所のセイコーマートに行って，
住み場所の火災保険 2 万円 (2 年ぶん)
を支払う．
-
夜中にインターホンの呼び出し．
もともと雑音が多くて，
よくわからないのだけど
「桑園西交番の……」
うんぬんとか言ってて不審なかんじなので，
「タイホされるようなことは何もしてないはずだが
(苗畑の柵ごえがまずかったのかな)……」
と玄関に降りてみると，
その周囲は警官・消防士・消防車・救急車
……
-
じつは私は何の関係もなくて，
「誰でもいいからさっさとこのマンションの玄関をあけてくれ」
という趣旨でよばれたと判明した．
周囲のウワサだと，
ここの住人の誰かが警察をよんだんだけど，
その後応答がなかったので火事の可能性も考慮して消防車群が
出動したといったいったことのようで
……
しばらく見物してたんだけど，
けっきょく，
真相はぜんぜんわからん．
消防のヒトたちが完全装備でとある階になだれこんだようだけど，
とくに何かを消火したり誰かを救助したわけでもなさそう．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0840):
ココペライのミニバゲットとか．
ダイコン・ニンジン・ブナシメジのコンソメスープ．
- 昼 (1320):
北 1 西 17 のマーノ・エ・マーノ．
シェフおすすめのワンプレートランチ，
豚肩のロースト，
スパゲッティージェノヴェーゼ，
フォカッチャ，
ラタトウィユ，
サラダ
……
ともりだくさん & すばらしきカオス．
さらにデザートとコーヒー
(これはいい香り & 温度だった)．
- 晩 (1910):
米 0.5 合．
ネギ・豆腐の味噌汁．
トマト・ニラ・タマネギ・シイタケ・豚肉のハーブ炒め．
ホウレンソウのゴマあえ．
2012 年 05 月 14 日 (月)
-
ここで，
たとえば
depth <- rgl.pixels(component="depth")
などとすると，
この画像の「深度」なんぞが得られて行列 depth
に格納される
(RGB その他の取得も可能)．
取得された値を
image(depth)
で図示するとこうなる．
-
まあ，
自分で ray casting/tracing なあれこれを工夫するよりは，
速いんではないかと思うんだけど
……
どうだろうねえ．
-
とはいえ，
こういう研究はとうぶんできそうにない．
-
で，
自分にはあまり関係なさそうな方面の問い合わせというか何というか
……
えーと，
Fisher's condition
(それについて言及されてる数少ない
論文の例)
というのは，
Fisher の性比の進化理論にでてくる概念 (を Houston & McNamara 2005
で勝手に命名した??) で，
統計学とは何の関係もなさそうなんだが
……
-
昼飯．
-
午後は大学雑用．
こういうのとか，
Subject: 北大祭環境科学院 2012 サイエンストークの依頼
植物生態学コースの久保です．6 月 9 日 (土) と 10 日 (日) の北大祭の
環境科学院施設公開で生物圏専攻担当の北大祭施設公開実行委員を申
しつけられております．その中に「サイエンストーク」という企画が
あり，これは来場した一般の人たちあいてに研究紹介をしていただく
ものなのですが，今回はこれを小泉さんにお願いできないだろうかと
いうことでメイルをさしあげております．トピックとしてはニホンザ
リガニについてお願いしたいのですが，他にも一般の人たちに興味を
もってもらえるものでしたら，何でもかまいません．
「サイエンストーク」のおおよその概要は次のとおりです:
・6/9 と 6/10 それぞれ一回ずつ
・時間は 13:00-15:00 ぐらい (未定) のうち 20 分間
(自分のトークの時間以外は拘束されません)
・場所は地環研玄関ホール，液晶プロジェクター使用可
このような内容です．ご検討いただけると助かります．よろしくお願
いいたします．
たいへん恐縮ですが，5/18 (金) ぐらいまでにお返事をいただけないで
しょうか．不明な点などありましたら御連絡ください．
あるいはこういうメイルだとか，
Subject: 北大祭環境科学院 (2012) サイエンスパフォーマンスの依頼
植物生態学コースの久保です．6 月 9 日 (土) と 10 日 (日) の北大祭の環境
科学院施設公開で生物圏専攻担当の北大祭施設公開実行委員を申しつけら
れております．この企画についてお願いがあります．
昨年，森川さんの研究室の皆様に担当していただいたサイエンスパフォー
マンス「90℃で生きる高温微生物の姿」が好評でしたので，今年度もお願
いしたいと考えております．御検討いただけると助かります．
企画の概要は以下のとおりです．
・6/9 (土), 6/10 (日) の二日間，10:00-16:00
・場所: D101, D102 講義室
・机、イス、掲示用パネル、延長コードなどは準備します
(必要個数をお知らせください)
・展示紹介をしてくださる学生さんには謝金が支払われます
(各展示日ごとの人数をお知らせください)
たいへん恐縮ですが，5/18 (金) ぐらいにお返事をいただけないでしょうか．
よろしくお願いいたします．
その他あれこれをあちこちにばらまいていた．
また数年以内に同じ雑用をおおせつかるだろうから
(前回は3 年前)，
そのときに流用するためにこのへんにはってみる
……
来年の担当者に対する説明用に使うこともあるので．
-
1750 研究室発．
買いもの．
1820 帰宅．
晩飯の準備のてつだい．
晩飯．
-
なぜかしら倫敦館にコーヒーのみにいったり．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
米 0.5 合．
ネギ・豆腐の味噌汁．
- 昼 (1230):
研究室．
米 0.7 合．
鶏のからあげ．
ソーセイジ．
野菜天．
ミニトマト．
レタス．
- 晩 (1940):
米 0.5 合．
ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・豚肉の煮物．
ミズナ・エリンギ・アブラゲの炒めもの．
2012 年 05 月 15 日 (火)
-
0620 起床．
ラジオ体操．
弁当・朝飯の準備．
朝飯．
コーヒー．
0750 自宅発．
0820 研究室着．
-
なかなか
岩波統計モデル本
の表紙がでないな．
撮影中
とのこと．
今週の金曜日に発刊のはずだけど，
ぜんぜん実感がない．
以前に「R グラフィックス」を翻訳出版した共立出版と，
今回の岩波書店，
どちらも科学系の本をいろいろあつかっているわけだが，
ずいぶんと対応がちがう．
-
なぜかまた三次元レンダリングについての試行錯誤
……
現実逃避的ですなぁ．
-
1030 より
研究室セミナー，
D1 の研究計画の紹介．
先週と同じ感想，
「だいじょうぶなのか」．
-
昼飯．
-
なぜかしら，
いろいろとどこおっているメイル返信かき．
途中，
でーた解析こんさるがはいってきたり．
-
なぜかしら，
「行動生物学事典」というのにいくつかの項目を書くことになってしまったので，
その相談．
-
また三次元逃避．
Category:Free 3D graphics software
をうろうろ．
昨日の R の
library(rgl)
の rgl.pixels() 関数に相当する OpenGL の関数は
……
glReadPixels()
かな．
お，
OpenGL Wiki の
Framebuffer Object
もおもしろそうだな
……
-
1750 研究室発．
買いもの．
1820 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
-
3-5 月の灯油使用量 23 l，2222 円．
1-3 月は 85 l．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
米 0.5 合．
ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・豚肉の煮物．
- 昼 (1220):
研究室．
米 0.7 合．
シシャモ．
野菜天．
ブロッコリー．
ミニトマト．
ミズナ．
- 晩 (1920):
米 0.5 合．
ジャガイモ・ニンジン・タマネギ・豚肉の煮物．
サバの開き．
豆腐．
カブの葉・エノキダケ・油揚げの煮びたし．
[サバのひらき]
ちょっと珍しいものが届いたので，
さっそく食べてみた．
開きなので収縮ぎみなんだけど，
けっこう食べごたえあり．
2012 年 05 月 16 日 (水)
-
0620 起床．
ラジオ体操．
弁当・朝飯の準備．
朝飯．
コーヒー．
0750 自宅発．
ちょっと雨．
0820 研究室着．
-
明後日には 岩波統計モデル本
が発刊されるはずなんだけど，
岩波サイトではあいかわらず表紙は
撮影中
みたいだし (かなり芸術性を重視するカメラマンが担当しているようだ)
……
ちなみに，
2009 年 10 月発刊のR グラフィックス
(共立出版) の場合，
発刊一ヶ月以上前に表紙デザイン・ネット上での
おひろめは完了，
発売のずっと前から新着商品
として注目されてて，
実際に流通する一週間前
には本がてもとにとどいていたんだけど
……
(後記: 翌日になって，
よーやく科学書の
top page
で表紙画像がでました)
-
この件，
正午すぎに岩波書店から連絡いただき，
本日中に北大にむけて 10 冊ほど送ってくださるとのこと．
たいへんありがたくはあるのだが
……
北大は学内便が遅いので，
金曜日には受けとれず来週になってしまうかもしれないな．
-
Luis がいきなりとびこんできて
……
Ubuntu (Linux distribution) 修繕依頼．
boot であれこれ
[OK] でて止まった場合には，
Alt + F1 でコンソールに移動してログイン，
sudo service gdm restart
で GUI に移動できる．
-
北大くらうどに移動した研究室さーばーの mail まわり，
もうすこしだけ見なおしてみる作業．
Port 転送に問題あったかしらん，
と 25 番をどうこうしてみたけど影響なし．
そもそも研究室さーばー内の Postfix までは到達していて，
kubo というのが
unknown user
あつかいされているから配送されないわけで
……
たしかに関係ないよな．
よくわかからん．
-
また北大祭関係の雑用メイルかき．
-
ちょっと植物シミュレイターの論文ながめる．
[最新の計算植物学 review]
Przemyslaw Prusinkiewicz and Adam Runions. 2012.
Computational models of plant development and form.
New Phytologist, 193: 549–569. doi:
10.1111/j.1469-8137.2011.04009.x
．
Prusinkiewicz
はポーランド出身でカルガリー大学にいるこの方面の有名人，
Algorithmic Botany
をかかげているヒト．
この review では，
おもに植物の発生生物学 (developmental biology)
のヒトたちを対象として，
「植物のシミュレイションモデルでいろいろわかりますよー」
とうりこんでいる．
-
昼飯．
-
午後も --- 客観的にみれば現実逃避的な --- 論文よみ．
-
データ解析こんさるメイル，
なかなかの難問が
……
-
1750 研究室発．
買いもの．
1820 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
米 0.5 合．
ネギ・干しシイタケ・麸のすまし汁．
鶏レバのショウガ煮．
キュウリのピクルス．
野菜天．
- 昼 (1200):
研究室．
米 0.7 合．
ニシンの丸干し．
ブロッコリー．
ミニトマト．
ミズナ．
- 晩 (1910):
ハクサイ・ネギ・エノキダケ・豆腐・鶏肉の鍋．
卵雑炊．
2012 年 05 月 17 日 (木)
-
0620 起床．
ラジオ体操．
弁当・朝飯の準備．
朝飯．
コーヒー．
0750 自宅発．
晴．
0820 研究室着．
-
お，
よーやく
……
-
これは，
Asial Blog
の中川さんの作例を参考にした (というか，
ほとんどまるうつしした) もの．
アカウントの内容をみているのではなく，
kubobook という文字列を含むすべての
tweet を表示している．
-
てなことに時間をついやしてしまって，
午前終了
……
昼飯．
-
午後も雑用，
そして岩波本直販ふぉーむづくり
……
-
1740 研究室発．
買いもの．
1810 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
米 0.5 合．
ネギ・油揚げの味噌汁．
キュウリのピクルス．
- 昼 (1230):
研究室．
米 0.7 合．
ヒメタラ．
野菜天．
ブロッコリー．
ミニトマト．
ミズナ．
- 晩 (1930):
米 0.5 合．
ネギ・サツマイモ・油揚げの味噌汁．
ホウレンソウ・トマト・エリンギ・豚肉の炒めもの．
2012 年 05 月 18 日 (金)
-
0620 起床．
ラジオ体操．
今日は弁当なしの日．
朝飯の準備．
朝飯．
コーヒー．
0750 自宅発．
0820 研究室着．
-
午前中は北大祭展示雑務におわれる．
あちこちに確認メイルをだす作業
……
-
昼飯．
-
おお，
ようやく統計モデリング本
がとどいた!
[「ひらづみ」ごっこ]
本日が刊行日であるけれど，
まだ書店にはでまわっていないので．
Twitter
で教えていただいたんだけど，
岩波書店の刊行日は出庫日。都内では午後から店頭に出る場合もあるそうですが、通常は刊行日翌日以降になります。Amazonはいつも小社刊行日より１日遅れの日付を「発売日」としているようです。
とのこと．
まあ，
出版社によって「刊行日」の定義がさまざまであるということで．
-
1730 研究室発．
買いもの．
1800 帰宅．
晩飯の準備．
晩飯．
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
米 0.5 合．
ネギ・サツマイモ・油揚げの味噌汁．
- 昼 (1320):
研究室．
ぱん吉のパン．
- 晩 (1900):
米 0.5 合．
ハクサイ・鶏肉のポン酢蒸し．
キュウリ・ニンジン・カブのピクルス．
2012 年 05 月 19 日 (土)
-
0620 起床．
ラジオ体操．
弁当・朝飯の準備．
朝飯．
コーヒー．
0750 自宅発．
0820 研究室着．
-
統計モデリング本
の著者割引本販売サイトづくり
……
-
どうもこういうプログラミングづくりはひさしぶりで
……
はかどらない．
-
昼飯の準備．
昼飯．
-
午後もうだうだ
……
-
とりあえず，
走ってみますか
……
1650 自宅発．
晴れ．
今日は宮の森の斜面をかけあがるコース，
大倉山ジャンプ台周辺の高級住宅地内の坂道をのぼりくだり
……
1700 帰宅．
-
うーむ
……
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
ぱん吉のパン．
ハクサイ・鶏肉のポン酢蒸し．
キュウリ・ニンジン・カブのピクルス．
- 昼 (1200):
ニラ・タマネギ・豚肉の焼きそば．
- 晩 (1940):
ホワイトアスパラガスのバター蒸し．
ソイのアクアパッツァ．
スープとチーズでリゾット．
2012 年 05 月 20 日 (日)
-
0720 起床．
ラジオ体操．
朝飯の準備．
朝飯．
紅茶．
-
1105 自宅発，
ミニ大通公園走．
晴れているので樹冠下や建物の影を走るようにする．
昨日の斜面のぼりおり走のくたびれがまだ脚にのこっている
……
1145 帰宅．
体重 73.8 kg．
体重は，
へらん．
-
なぜかしら地下鉄西 18 丁目駅ちかくで，
ぜいたくな昼飯．
-
その近辺の古本屋とかをうろうろしたり
……
-
夕方に帰宅してからまた家をでて，
晩飯の買いもの．
-
晩飯の準備．
晩飯．
-
直販さいとのプログラミングがすすまない
……
-
[今日の運動]
-
[今日の食卓]
- 朝 (0700):
米 0.5 合．
ハクサイ・鶏肉のポン酢蒸し．
キュウリ・ニンジン・カブのピクルス．
- 昼 (1250):
S 1 W 20 の Yukio Sasaki でおいしい昼ごはんを食べました．
- 晩 (1930):
米 0.5 合．
ネギ・豆腐の味噌汁．
チンゲンサイ・ネギ・ブナシメジ・ホタテの炒めもの．
キュウリ・ニンジン・カブのピクルス．
